A formalização da matrícula do aluno num dos cursos do STB é um ato executado pela secretaria com base nos elementos fornecidos no processo de candidatura.
A matricula permanecerá válida enquanto o aluno não concluir o curso a que se candidatou, embora tenha de se inscrever semestralmente nas disciplinas que pretende frequentar.
Durante a frequência do curso em que se matriculou, o aluno pode solicitar a transferência para outro curso, sem necessidade de uma nova candidatura, observadas que sejam as condições para frequentar o curso para o qual solicitou a sua transferência.